思いのほか、SDカードが早く届いたのでダウンロードも開始。公式には3DSでは32GBまでの容量しかサポートされていないところ、64GBのものを間違って買ってしまったので無理くりFAT32でフォーマットしてます。より通常なexFATを3DSが読まないのはMicrosoftとのライセンス問題でしょうかね?
$ sudo diskutil eraseDisk FAT32 NONAME MBRFormat /dev/disk2
作業したのはmacOS上です。ネット上では利用自己責任なんて言うように危ぶむ声もあるようですが、技術的に何か問題が起こるとも思えなかったのでよしとします。問題ない。